پروبیوتیک‌های طبیعی موجود در بدن مادر، از جمله لاکتوباسیلوس‌ها و بیفیدوباکتریا، از دوران بارداری میکروبیوم جنین را شکل می‌دهند و پس از تولد در شیر مادر به نوزاد منتقل می‌شوند. این باکتری‌های مفید در شش ماه نخست زندگی با تقویت رشد باکتری‌های مفید در روده نوزاد و تنظیم پاسخ‌های ایمنی او، سلامت گوارش و سیستم ایمنی نوزاد را حمایت می‌کنند.